晶码战士第三部全集走りで最強を目指すと豪語するジャングルポケットは＜トゥインクル・シリーズ＞でのフジキセキの走りに衝撃を受け、レースの世界に飛び込む。　　トレーナーと共にデビューを果たしやジャングルポケットは、一生に一度しか走れない栄誉あるクラシック三冠レースに挑む。　　しかしそこに立ちふさがったのはアグネスタキオンやマンハッタンカフェといった同世代のライバルたちだった。　　新時代の扉を開く熱き戦いが、いま始まる―。